Quantifizierung und Effizienztestung der viralen Partikel
Wie viele virale Partikel hat meine Virusproduktion? Wie stark exprimiert der Virus das gewünschte Transgen? Wie effektiv ist der Virus? All diese Fragen lassen sich in unserer Core Facility beantworten. Sie können aus einer Reihe unterschiedlichster molekularer und zellbiologischer Methoden wählen.
Sie befinden sich hier:
Folgende Möglichkeiten der Charakterisierung des Viruses bieten wir an:
• Titration in Zellkulturen durch Analysis einer Reportergenexpression des Viruses
• Quantifizierung durch qPCR des viralen Genoms
• Effizienztestung durch qPCR des transgene Expression im Vergleich zum Wildtyp einer nicht infizierten Zelle
• Effizienztestung durch Proteinanalyse mittels Western-Blot-Techniken (shRNA oder Expressionsvektoren)
Kosten Virus-Quantifizierung und Effizienztest
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Leistung |
Kosten |
Beschreibung |
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Quantifizierung der Reportergen-Expression |
125 € Intern, 150 € BUA*, 200 € Extern |
Titrierung des Viruses in Zellkulturen (Primare Neurone, HEK-Zellen oder Zellen durch den Nutzer bereitgestellt) und Analyse der Reportergen-Expression (Fluoreszenz) |
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Adenovirus-Quantifikation durch Anti-Hexon-Immunfärbungen |
205 € Intern, 225 € BUA*, 260 € Extern |
Titrierung von adenoviralen Partikeln in HEK293A-Zellen durch Anfärbung des adenoviralen Hexon-Proteins (ifu/ml) |
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Quantifikation durch qPCR des viralen Genoms (1-2 Viren) |
100 € Intern, 125 € BUA*, 150 € Extern |
qPCR auf genomische Sequenzen der viralen Partikel |
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Quantifikation durch qPCR des viralen Genoms (ab 3 Viren) |
70 € Intern, 85 € BUA*, 100 € Extern |
ab 3 Viren verringert sich der Preis der qPCR pro Virus. |
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Effizienztest durch Analyse der Expression des Transgen-Transkrips und der shRNA-Funktion auf cDNA-Ebene |
600 € Intern, 650 € BUA*, 700 € Extern |
qPCR auf Transgen-Transkripte und Korrelation zu dem korrespondierenden Wildtyp-Transkript; beinhaltet das strategische Design, RNA-Präparation, cDNA-Synthese und qPCR. |
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Effizienztest durch Analyse der Transgen-Expression und shRNA-Funktion auf Proteinebene |
290 € Intern, 400 € BUA*, 500 € Extern |
Western Blot für Transgen-Expression und Vergleich zum Wildtyp-Protein (getestete und funktionale Antikörper sind vom Nutzer bereitzustellen) |
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*BUA = Berlin University Alliance, Arbeitsgruppen innerhalb des Berliner Wissenschaftsnetzwerkes |
